El trabajo académico del Instituto Chacabuco está animado por las Asesoría Pedagógicas de Enseñanza Básica ( Jesús Varas M. ) y Enseñanza Media ( Jenny Díaz C. ).

Los Departamentos de Asignaturas reúnen a los docentes según la disciplina que imparten desde 5° Básico a 4° Medio. Su misión es planificar y ejecutar las políticas curriculares emanadas de MINEDUC y de los proyectos académicos colegiales.

En sesiones semanales, cada Departamento reflexiona acerca de sus prácticas pedagógicas, comparte criterios de estrategia, elabora intervenciones innovadoras, crea material de trabajo y diseña instrumentos de evaluación.

Los jefes de Departamento se reúnen periódicamente en encuentros convocados por la Asesoría Pedagógica de E. Media, y concurren también tres veces al año a reuniones sectoriales en la ciudad de Santiago.